Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm38018-201ENSMUST00000195651 540 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Vmn1r192-201ENSMUST00000072632 1067 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ms4a4dQ99N05 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ms4a4dQ99N05 Gm15787-203ENSMUST00000130892 1250 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ms4a4dQ99N05 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ms4a4dQ99N05 Gm40263-201ENSMUST00000197468 580 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ms4a4dQ99N05 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ms4a4dQ99N05 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ms4a4dQ99N05 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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Ms4a4dQ99N05 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Scfd2-203ENSMUST00000113542 2279 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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Ms4a4dQ99N05 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ms4a4dQ99N05 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
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