Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm42693-201ENSMUST00000196779 631 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Txnl4b-202ENSMUST00000178445 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Tpd52-204ENSMUST00000094381 1074 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm26871-201ENSMUST00000180593 700 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pramel1Q99MW3 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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