Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ8

Nus1, Dehydrodolichyl diphosphate synthase complex subunit Nus1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nus1Q99LJ8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Nus1Q99LJ8 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Nus1Q99LJ8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Nus1Q99LJ8 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Nus1Q99LJ8 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Nus1Q99LJ8 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Nus1Q99LJ8 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
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Nus1Q99LJ8 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Nus1Q99LJ8 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
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Nus1Q99LJ8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Nus1Q99LJ8 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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Nus1Q99LJ8 Dhx9-202ENSMUST00000186380 4561 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Nus1Q99LJ8 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
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