Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm45564-201ENSMUST00000210460 530 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Psme2b-201ENSMUST00000104958 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Ggt5-203ENSMUST00000189972 648 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Hcfc1r1-201ENSMUST00000024697 946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Pomgnt1-202ENSMUST00000106496 2613 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Decr2-201ENSMUST00000040907 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Tmem205-203ENSMUST00000213698 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RtcbQ99LF4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Asgr1-201ENSMUST00000018699 1259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Pycr1-201ENSMUST00000026133 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RtcbQ99LF4 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms