Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Ddx42-201ENSMUST00000021046 4011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Vmp1Q99KU0 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
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Vmp1Q99KU0 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Vmp1Q99KU0 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
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Vmp1Q99KU0 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
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