Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

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Length 376 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
TrabdQ99JY4 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Krt36-201ENSMUST00000107416 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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TrabdQ99JY4 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
TrabdQ99JY4 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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