Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

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Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Rab11fip1-201ENSMUST00000033878 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Map6-201ENSMUST00000068973 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Pacsin3Q99JB8 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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Pacsin3Q99JB8 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Dpp6-204ENSMUST00000122171 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Luc7l3-202ENSMUST00000107820 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Tbx4-201ENSMUST00000000096 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Eya1-203ENSMUST00000168081 4366 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Trabd2b-201ENSMUST00000094894 6617 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Pacsin3Q99JB8 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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