Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Ddb2Q99J79 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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Ddb2Q99J79 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ddb2Q99J79 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
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