Protein–RNA interactions for Protein: Q99J25

Mrm1, rRNA methyltransferase 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrm1Q99J25 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Opn4-201ENSMUST00000022331 2156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Rab10os-207ENSMUST00000179924 823 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Mrm1Q99J25 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
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