Protein–RNA interactions for Protein: Q923L3

Csmd1, CUB and sushi domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 3,564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csmd1Q923L3 Gm43058-201ENSMUST00000197645 625 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ptges3l-203ENSMUST00000107252 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Pagr1b-201ENSMUST00000172958 693 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Rps3a1-201ENSMUST00000029722 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ggact-201ENSMUST00000038075 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Cd7-201ENSMUST00000026159 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Mafk-201ENSMUST00000018287 2849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm44992-206ENSMUST00000209313 1261 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Nmnat1-201ENSMUST00000030845 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Morn3-201ENSMUST00000031437 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tsta3-201ENSMUST00000023231 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm13813-201ENSMUST00000120998 787 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Mpc1-202ENSMUST00000124023 555 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Itm2b-204ENSMUST00000228637 783 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm9083-201ENSMUST00000120423 819 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Hax1-206ENSMUST00000197786 857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Csmd1Q923L3 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm45770-201ENSMUST00000212105 616 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Serf1-203ENSMUST00000132053 516 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Rgs17-203ENSMUST00000117676 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Csmd1Q923L3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
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