Protein–RNA interactions for Protein: Q922J3

Clip1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip1Q922J3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Cd37-201ENSMUST00000033063 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Krtcap2-201ENSMUST00000040888 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Rps13-203ENSMUST00000205490 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Trav4d-2-201ENSMUST00000120914 335 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm15444-201ENSMUST00000148335 388 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Rab15-204ENSMUST00000122419 856 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm26721-201ENSMUST00000181723 992 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Il27-201ENSMUST00000058429 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Sostdc1-201ENSMUST00000041407 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm27331-201ENSMUST00000183705 60 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm9124-201ENSMUST00000191789 1092 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm9113-201ENSMUST00000192510 1018 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm9131-201ENSMUST00000193557 1089 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm9121-201ENSMUST00000193749 1071 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm43755-201ENSMUST00000200001 408 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Clip1Q922J3 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm17330-201ENSMUST00000221047 165 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Fam173a-201ENSMUST00000072735 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Clip1Q922J3 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms