Protein–RNA interactions for Protein: Q91XE9

Creb3l3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l3Q91XE9 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Zfp57-211ENSMUST00000174524 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Fam160a2-204ENSMUST00000122327 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Klhl18-203ENSMUST00000198164 4538 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Creb3l3Q91XE9 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Fnbp1-209ENSMUST00000113562 4515 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Creb3l3Q91XE9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms