Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Smg8Q8VE18 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smg8Q8VE18 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Smg8Q8VE18 Gh-201ENSMUST00000103071 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Smg8Q8VE18 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Smg8Q8VE18 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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