Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCS3

Fam20b, Glycosaminoglycan xylosylkinase, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20bQ8VCS3 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Ptch2-201ENSMUST00000030443 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Tigd2-201ENSMUST00000062626 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Lzts3-202ENSMUST00000089561 4169 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Fam20bQ8VCS3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.2 ms