Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Atp2a3-204ENSMUST00000108486 4540 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Slc35e2-202ENSMUST00000105608 6291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm32036-201ENSMUST00000221484 2638 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Hoxc12Q8K5B8 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Hoxc12Q8K5B8 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm28043-201ENSMUST00000130871 6521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
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Hoxc12Q8K5B8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gse1-201ENSMUST00000034279 7127 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Nphp4-201ENSMUST00000056567 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Chpf2-201ENSMUST00000088295 5371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Ddx46-201ENSMUST00000099479 5664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.74□□□□□ -0.53
Hoxc12Q8K5B8 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC11.74□□□□□ -0.53
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