Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Brd3Q8K2F0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Pisd-202ENSMUST00000071829 1986 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Nek7-201ENSMUST00000027642 3737 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 AC154262.2-201ENSMUST00000224310 2293 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Apln-201ENSMUST00000039026 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Rbpms2-202ENSMUST00000169003 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Brd3Q8K2F0 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms