Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gne-209ENSMUST00000173234 2149 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm5592-202ENSMUST00000206490 2623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Fastkd3-201ENSMUST00000051784 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Slc39a8-201ENSMUST00000029810 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Gnat2-201ENSMUST00000058669 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.51
SbsnQ8CIT9 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Parp2-201ENSMUST00000036126 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Rims1-205ENSMUST00000097811 6446 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Fam198a-203ENSMUST00000214536 2789 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Dcaf7-201ENSMUST00000058438 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Ctgf-203ENSMUST00000176228 2490 ntTSL 2 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 AI661453-202ENSMUST00000150819 4866 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Cdyl-202ENSMUST00000163595 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 0610010F05Rik-208ENSMUST00000180260 4128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Gm20700-201ENSMUST00000176749 2206 ntTSL 3 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Pitpnm2-204ENSMUST00000159677 1690 ntTSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
SbsnQ8CIT9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms