Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD4

Snx8, Sorting nexin-8, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx8Q8CFD4 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Azi2-201ENSMUST00000044454 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Abr-205ENSMUST00000108408 3534 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Pdcd6ip-201ENSMUST00000035086 5951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Heg1-201ENSMUST00000126532 6714 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Ggn-201ENSMUST00000033886 588 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gm45779-201ENSMUST00000212189 4064 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Otub2-201ENSMUST00000021620 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Snx8Q8CFD4 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms