Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFA7

Klf17, Krueppel-like factor 17, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf17Q8CFA7 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Slc12a4-201ENSMUST00000034370 3811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Cradd-202ENSMUST00000217809 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.13□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Urm1-201ENSMUST00000091142 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Klf17Q8CFA7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.12□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms