Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEQ0

Cdkl1, Cyclin-dependent kinase-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Cdkl1Q8CEQ0 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Cdkl1Q8CEQ0 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms