Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

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Length 563 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cckar-201ENSMUST00000031093 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ccdc38Q8CDN8 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ccdc38Q8CDN8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ccdc38Q8CDN8 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Ccdc38Q8CDN8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ptprr-204ENSMUST00000128399 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 St8sia3-201ENSMUST00000025477 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Fahd1-201ENSMUST00000049642 1407 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc38Q8CDN8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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