Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCN5

Bcas3, Breast carcinoma-amplified sequence 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 928 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas3Q8CCN5 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm19078-201ENSMUST00000206311 727 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Fam214b-202ENSMUST00000107956 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm16175-201ENSMUST00000128181 248 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Bcas3Q8CCN5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.2 ms