Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCI5

Rybp, RING1 and YY1-binding protein, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RybpQ8CCI5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
RybpQ8CCI5 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 B3gat1-206ENSMUST00000161431 3858 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.21□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Cep85-201ENSMUST00000040271 3893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Gm27989-201ENSMUST00000184721 107 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
RybpQ8CCI5 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
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