Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Tcp11l1-201ENSMUST00000028597 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 4930592C13Rik-201ENSMUST00000196791 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ppfibp1Q8C8U0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms