Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0J2

Atg16l1, Autophagy-related protein 16-1, mousemouse

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Length 607 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg16l1Q8C0J2 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Atg16l1Q8C0J2 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Atg16l1Q8C0J2 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Atg16l1Q8C0J2 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Atg16l1Q8C0J2 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Atg16l1Q8C0J2 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
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Atg16l1Q8C0J2 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Atg16l1Q8C0J2 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Atg16l1Q8C0J2 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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Atg16l1Q8C0J2 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Tmprss11d-202ENSMUST00000122377 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Mfap4-202ENSMUST00000064783 1722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Zc3h4-201ENSMUST00000098789 6039 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Atg16l1Q8C0J2 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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