Protein–RNA interactions for Protein: Q8BX13

Ube3d, E3 ubiquitin-protein ligase E3D, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube3dQ8BX13 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
Ube3dQ8BX13 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Itgb3-201ENSMUST00000021028 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
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Ube3dQ8BX13 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Tfap2c-206ENSMUST00000170744 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Ube3dQ8BX13 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
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