Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVL3

Snx17, Sorting nexin-17, mousemouse

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx17Q8BVL3 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 2010106C02Rik-201ENSMUST00000191222 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Dnd1-ps-201ENSMUST00000196992 964 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx17Q8BVL3 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm13342-201ENSMUST00000121055 207 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx17Q8BVL3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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