Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ffar1-201ENSMUST00000052700 4175 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Rbm8a-202ENSMUST00000196456 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Gm18636-201ENSMUST00000218846 1066 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Pdcl3Q8BVF2 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Nepn-201ENSMUST00000067085 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Armc6-201ENSMUST00000019679 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Pex26-202ENSMUST00000118234 3778 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Mgll-201ENSMUST00000089449 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm7104-201ENSMUST00000179741 2532 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Usp10-210ENSMUST00000144458 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Smug1-201ENSMUST00000064067 3281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Npr1-201ENSMUST00000029540 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Cd276-202ENSMUST00000165365 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Chfr-202ENSMUST00000112519 3159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm43051-201ENSMUST00000201096 2678 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tmem41b-202ENSMUST00000118429 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Sfta3-ps-201ENSMUST00000218376 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Nrxn1-201ENSMUST00000054059 4697 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pdcl3Q8BVF2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms