Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Elmo3-202ENSMUST00000212033 2351 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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Pggt1bQ8BUY9 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pggt1bQ8BUY9 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pggt1bQ8BUY9 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pggt1bQ8BUY9 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pggt1bQ8BUY9 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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Pggt1bQ8BUY9 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pggt1bQ8BUY9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pggt1bQ8BUY9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pggt1bQ8BUY9 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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Pggt1bQ8BUY9 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gnb1l-211ENSMUST00000167778 3569 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
Pggt1bQ8BUY9 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
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