Protein–RNA interactions for Protein: Q8BNE1

Tcaf1, TRPM8 channel-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 924 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf1Q8BNE1 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Pfdn6-204ENSMUST00000174048 560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Ins1-201ENSMUST00000039652 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Tcaf1Q8BNE1 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Susd2-201ENSMUST00000077610 2275 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Tcaf1Q8BNE1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms