Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 As3mt-201ENSMUST00000003655 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Serp1-201ENSMUST00000029385 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Grik4Q8BMF5 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms