Protein–RNA interactions for Protein: Q8BK35

Nop53, Ribosome biogenesis protein NOP53, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop53Q8BK35 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nop53Q8BK35 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nop53Q8BK35 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nop53Q8BK35 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Nop53Q8BK35 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Nop53Q8BK35 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nop53Q8BK35 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Egln3-201ENSMUST00000039516 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nop53Q8BK35 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nop53Q8BK35 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nop53Q8BK35 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nop53Q8BK35 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Nop53Q8BK35 Gpr107-201ENSMUST00000056433 6134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Nop53Q8BK35 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Nop53Q8BK35 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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