Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Usp1Q8BJQ2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Nt5c3b-202ENSMUST00000092689 1344 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Usp1Q8BJQ2 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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