Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHX3

Cdca8, Borealin, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdca8Q8BHX3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Shmt1-201ENSMUST00000018744 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Sun1-202ENSMUST00000078690 2608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Cdca8Q8BHX3 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cdca8Q8BHX3 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms