Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGV9

Atg4d, Cysteine protease ATG4D, mousemouse

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4dQ8BGV9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ccdc69-202ENSMUST00000108880 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 AC168058.1-201ENSMUST00000219521 2282 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Atg4dQ8BGV9 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atg4dQ8BGV9 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atg4dQ8BGV9 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atg4dQ8BGV9 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm18905-201ENSMUST00000205454 928 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atg4dQ8BGV9 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atg4dQ8BGV9 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atg4dQ8BGV9 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Atg4dQ8BGV9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Umad1-208ENSMUST00000162034 2015 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Bmp4-201ENSMUST00000074077 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Atg4dQ8BGV9 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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