Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGG7

Ubash3b, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein B, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubash3bQ8BGG7 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Myh14-203ENSMUST00000107900 6400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Bach2-202ENSMUST00000108180 8882 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Ubash3bQ8BGG7 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Lin54-208ENSMUST00000149714 3869 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Ubash3bQ8BGG7 Crls1-204ENSMUST00000124836 1267 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms