Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC1

UPF0489 protein C5orf22 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8BGC1 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 AC238940.1-201ENSMUST00000225106 1858 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Psmd2-201ENSMUST00000007212 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Cct3-ps1-201ENSMUST00000118023 1647 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Rnase10-201ENSMUST00000022424 1629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Q8BGC1 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Ubap2l-204ENSMUST00000195995 3516 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Q8BGC1 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.3 ms