Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGA3

Lrrtm2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrtm2Q8BGA3 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Qsox1-202ENSMUST00000111764 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gpr85-201ENSMUST00000060442 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Mcm6-201ENSMUST00000027601 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Kctd20-203ENSMUST00000118762 3839 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Erg-203ENSMUST00000113848 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Osbpl11-201ENSMUST00000039733 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Lrrtm2Q8BGA3 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms