Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Enox1-201ENSMUST00000022589 3142 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Trbc1-201ENSMUST00000103291 512 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm11899-201ENSMUST00000142373 745 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
ChfrQ810L3 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107 ms