Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQ69

Tmc3, Transmembrane channel-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmc3Q7TQ69 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Ppt2-201ENSMUST00000064953 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Ufc1-202ENSMUST00000111302 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Tmc3Q7TQ69 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.9 ms