Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNB8

Sbno2, Protein strawberry notch homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbno2Q7TNB8 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm6460-202ENSMUST00000163787 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm8879-201ENSMUST00000170260 1125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 4933402N22Rik-202ENSMUST00000170301 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 D930030I03Rik-201ENSMUST00000180735 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm20546-201ENSMUST00000173141 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 B3gnt7-201ENSMUST00000113306 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm26788-201ENSMUST00000181692 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sbno2Q7TNB8 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms