Protein–RNA interactions for Protein: Q715T0

Nme8, Thioredoxin domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme8Q715T0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Olfr142-201ENSMUST00000099752 918 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm15806-201ENSMUST00000120696 955 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Gm9002-201ENSMUST00000178437 499 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nme8Q715T0 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Gm12960-201ENSMUST00000120017 1066 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nme8Q715T0 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.1 ms