Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWR6

Syne1, Nesprin-1, mousemouse

Predictions only

Length 8,799 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne1Q6ZWR6 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Edem3-203ENSMUST00000188145 3262 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm27501-201ENSMUST00000183599 107 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 1700069L16Rik-203ENSMUST00000162388 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm11261-203ENSMUST00000132470 838 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 A930009A15Rik-201ENSMUST00000173620 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Camkmt-201ENSMUST00000095188 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
Syne1Q6ZWR6 Nfya-212ENSMUST00000162460 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
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