Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQF0

Topbp1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1Q6ZQF0 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm17586-201ENSMUST00000181502 908 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ceacam1-209ENSMUST00000206687 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 4933424G06Rik-204ENSMUST00000208994 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm30285-201ENSMUST00000214614 422 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 AC101945.2-201ENSMUST00000227886 1377 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rasgef1b-209ENSMUST00000168092 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rasgef1b-201ENSMUST00000031276 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 0610010K14Rik-203ENSMUST00000100950 545 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Lcn6-203ENSMUST00000114199 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Fut8-201ENSMUST00000062804 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Eif4e2-206ENSMUST00000113233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Hsd17b6-201ENSMUST00000026462 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Pax7-202ENSMUST00000174681 1725 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm11439-201ENSMUST00000118598 409 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm22121-201ENSMUST00000175148 54 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Chodl-203ENSMUST00000114216 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm8805-201ENSMUST00000117848 313 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm20457-201ENSMUST00000173374 682 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 2610016A17Rik-202ENSMUST00000186768 689 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Nsg2-203ENSMUST00000109409 641 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm2310-201ENSMUST00000179217 1131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Gm42797-201ENSMUST00000197573 494 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Kdelr1-203ENSMUST00000211234 832 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Pcgf5-203ENSMUST00000224679 1269 ntAPPRIS P5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Itln1-201ENSMUST00000043094 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Topbp1Q6ZQF0 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms