Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Trak1Q6PD31 Mapt-201ENSMUST00000100347 1362 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gm37753-201ENSMUST00000192178 439 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Cfc1-201ENSMUST00000027298 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trak1Q6PD31 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms