Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX9

Trim37, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM37, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim37Q6PCX9 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 1110028F18Rik-201ENSMUST00000183365 1341 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Msx3-201ENSMUST00000055353 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim37Q6PCX9 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim37Q6PCX9 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
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Trim37Q6PCX9 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Trim37Q6PCX9 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
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