Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm13070-201ENSMUST00000146532 768 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm44397-201ENSMUST00000195950 113 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 4933417O13Rik-202ENSMUST00000208893 1571 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Rsf1os2-203ENSMUST00000155074 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm29152-201ENSMUST00000189284 325 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Nop58-201ENSMUST00000027174 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Zbtb40Q6PCS8 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms