Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Mmp11-202ENSMUST00000120281 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Rdm1-201ENSMUST00000010506 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
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Atg9bQ6EBV9 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Atg9bQ6EBV9 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Rbmx2-201ENSMUST00000033433 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Atg9bQ6EBV9 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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