Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm10608-202ENSMUST00000213924 676 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Mrgprf-201ENSMUST00000033386 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 4930407G08Rik-201ENSMUST00000145831 698 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm43763-201ENSMUST00000201761 683 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Atp6v0c-ps1-201ENSMUST00000206596 463 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Scaf8Q6DID3 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Scaf8Q6DID3 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms