Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZK6

Jmjd1c, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 2,350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd1cQ69ZK6 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Pym1-203ENSMUST00000218218 1143 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Jmjd1cQ69ZK6 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Pam-202ENSMUST00000097625 4102 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.35
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Jmjd1cQ69ZK6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Jmjd1cQ69ZK6 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Jmjd1cQ69ZK6 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Jmjd1cQ69ZK6 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Hsd3b6-202ENSMUST00000170847 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Jmjd1cQ69ZK6 F630206G17Rik-201ENSMUST00000137002 685 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Jmjd1cQ69ZK6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Jmjd1cQ69ZK6 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Jmjd1cQ69ZK6 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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Jmjd1cQ69ZK6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm28727-201ENSMUST00000176549 443 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
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Jmjd1cQ69ZK6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Jmjd1cQ69ZK6 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
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